Human Methylome受託解析サービスでは、NGSを用いてヒトの組織検体や血しょう中セルフリーDNAなどリキッドバイオプシーから得られた微量サンプルの網羅的なDNAメチル化プロファイルを取得します。バイオマーカー探索やがん・神経変性・循環器・代謝性疾患のモニタリングに適しています。
独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元にお届けします。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。
Human Methylomeサービスの特徴
・Human Methylomeパネルを用いることにより、メチル化バイオマーカーの同定を実現
・398万箇所以上のCpGサイトを解析可能
・123Mbのパネルが、ヒトのCpGアイランドサイトの84％以上をカバーします。
・WGBSより高い費用対効果を有します
・高いカバレッジでデータ取得します
・Twist Bioscienceの技術を活用
Human Methylome受託解析で高度なDNAメチル化検出を実現
受託解析でウェット作業はお任せ・豊富な経験を基にサービスを提供
Step 1:
・ゲノムDNAの品質チェックとgDNAのせん断
・断片化処理
Step 2:
・酵素的塩基変換
・ライブラリー構築と特異配列のキャプチャー
Step 3:
・シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)
・ペアエンド150bp、サンプル当たり平均60 Mi raw reads – 理論カバレッジ >150x
バイオインフォマティクス解析
多彩な追加解析オプションを取り揃えています。
FAQ
本受託解析サービスでの必要DNA量は以下の通りです。
1回のHuman Methylome実験に必要なDNA量
- 最小必要量250ng (抽出ゲノムDNA) 、20ng (セルフリーDNA) 以上の量が必要です。5 ng/ul (抽出ゲノムDNA) 、1 ng/ul (セルフリーDNA)以上の濃度のDNA溶液を50 μL 以上お送りください。
DNAは蛍光分析法で定量してください。また、結果を最大化するため、ガイドライン (別紙「サンプル調製・送付ガイドライン」)を厳守してください。
血液、血漿中セルフリーDNA、尿、凍結組織、FFPE、細胞に対応します。
結果を最大化するため、ガイドライン (別紙「サンプル調製・送付ガイドライン」)を厳守してください。
反復実験を含めて、最低8サンプルより、また受入サンプル数は8の倍数で承っております。
Human Methylome受託解析サービスの流れ
DiagenodeのHuman Methylome受託解析サービスでは、お客様が抽出したゲノムDNAサンプルをお預かりし、処理および解析を行って結果をお知らせします。
以下にサービスの流れを簡単にご説明いたします。
1. お問い合わせ・お見積り
お見積りをご希望の方は、下のリンクをクリックして「お見積リクエストフォーム」よりお客様のサンプルについての情報をご入力ください。
送付いただきました情報を基にお見積を作成し、弊社営業担当者より折り返しお見積をお送りいたします。
お見積と共に、本サービスのサービスガイドライン及び解析結果の見本もお送りいたします。
サービスガイドラインは下のリンクからもダウンロードしていただけます。
Human Methylome受託解析サービス
正式なお見積りは弊社営業担当者、またはご利用の代理店を通してお手元にお届けいたします。
お見積りとともに「Biosafety form」をお送りいたしますので、サンプル調製・送付ガイドラインでサンプルの受託条件をご確認の上、サンプルの詳細情報をご記入いただけますようお願いいたします（輸出可否の確認をさせていただきます）。
海外のラボで分析を行います関係上、輸出規制に該当する品目を含むサンプルについてはご相談させていただく場合がございます。
必要に応じて、秘密保持契約・業務委託契約を締結させていただくことも可能です。
・サンプル調製・送付ガイドラインは “必ず” ご一読ください。
・“サンプル調製・送付ガイドライン“ に従っていないサンプルを提出された場合、追加料金が発生する可能性がございます。
サンプル調製・送付ガイドライン及びBiosafety formは下のリンクからダウンロードしていただくことが可能です。
①サンプル調製・送付ガイドライン
②Biosafety form
サービスの詳細や、その他のお問い合わせについて（資料請求、秘密保持契約の締結など）は、Diagenode SAグローバルサイト上の「お見積りボタン」をクリックしてお問い合わせください。
2. 注文書送付
受託解析をご依頼される際は注文書を弊社に直接、あるいは代理店を通してお送りいただきます。
注文を弊社で受領した段階で次の書類をお送りいたしますので、必要な情報をご記入の上、ご返送ください。
・サンプルIDシート
返送いただきましたら弊社で確認の上、分析するサンプルを送付していただくスケジュールを調整・ご連絡させていただきます。
3. サンプル送付
サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従ってゲノムDNAサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。
弊社で確認後、Diagenode SAにサンプルを送らせていただきます。
4. 解析作業
Diagenode SAで実施する作業は以下の通りです。
・サンプルの品質管理
Qubit (Thermo Fisher)を用いて品質管理を行います。サンプルに不備があった場合はこの段階で追加のサンプル提供についてご相談させていただきます。
・gDNAのせん断、断片化処理
・酵素的塩基変換
・ライブラリー構築と特異配列のキャプチャー
・シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)
・バイオインフォマティクスに基づく解析（一部オプション）
5. 納品物送付
解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。
詳しくはグローバルサイトをご覧いただくか、下のお問い合わせボタンをクリックしてお問い合わせフォームにご入力ください。弊社営業員が折り返しご連絡申し上げます。
ダイアジェノードポータルサイト（diagenode.co.jp）のサービス情報は、実際のサービス内容と異なる場合があります。情報の更新がある場合、お問い合わせ時に詳しくご案内させていただきます。
エピジェネティクス受託解析サービス
DiagenodeではInfinium Methylation EPIC Arrayの他にも多くのエピジェネティクス関連受託サービスを承っております。下のページにてご紹介しておりますので、ご希望の解析に応じてご検討ください。
