クロマチン免疫沈降では、抗体を用いた免疫沈降などを通じてサンプルのロスが生じやすい実験系です。ChIP-seqでは得られたクロマチンDNAを精製し、シーケンス用のアダプターを付加する必要があり、ライゲーション効率などがシーケンスライブラリーの質を左右します。

これに対し、タグメンテーション法ではTn5トランスポゼースを用いてDNA断片にシーケンスアダプターを高効率で導入できます。ChIP後のDNAに対し、タグメンテーションを行うことによってワンステップでシーケンスアダプターをクロマチンDNAに導入でき、ストリッピング・脱クロスリンクなどの処理後ただちに次世代シーケンス解析を行うことができます。

Diagenodeの高効率Tn5トランスポゼースであるTagmentaseはChIP-seqをはじめとした、エピジェネティクス研究の次世代シーケンスライブラリーの調製が必要なすべての分野において力を発揮します。