Tn5 transposaseを用いてタグメンテーション
クロマチン免疫沈降は、抗体を用いた免疫沈降などを通じてサンプルのロスが生じやすい実験系です。ChIP-seqでは得られたクロマチンDNAを精製し、シーケンス用のアダプターを付加する必要があり、ライゲーション効率などがシーケンスライブラリーの質を左右します。
これに対し、タグメンテーション法ではTn5トランスポゼース (Tn5 transposase)を用いてDNA断片にシーケンスアダプターを高効率で導入できます。ChIP後のDNAに対し、タグメンテーションを行うことによってワンステップでシーケンスアダプターをクロマチンDNAに導入でき、ストリッピング・脱クロスリンクなどの処理後ただちに次世代シーケンス解析を行うことができます。
Diagenodeの高効率Tn5トランスポゼースであるTagmentaseはChIP-seqをはじめとした、エピジェネティクス研究の次世代シーケンスライブラリーの調製が必要なすべての分野において力を発揮します。
DiagenodeのTagmentase
次世代シーケンスライブラリー調製に使用できます
DiagenodeのTagmentaseは高いDNA断片化、およびタグ導入効率を有していますので、ChIP-seq、ATAC-seqなどに広く使用していただくことが可能です。
すでにChIP-seqとタグメンテーションを融合した独創的なキットであるChIPmentationキットに採用され、良好な結果を提供しています。
また、すでに研究室独自のChIPのプロトコールをお持ちの研究者向けに、Tagmentaseを使用し、磁気ビーズで精製したChIP済みDNAに対してタグメンテーションベースのライブラリー調製機能を提供するTAG kit for ChIPmentationもご用意しております。
CUT&Tag法を用いて、精度が高く低インプットのChIP-seqを行いたいとお考えの方には、抗体にアンカーし近傍のDNAに対してタグメンテーションを行えるprotein A-Tn5 transposase (loaded)をご用意しております。
マルチプレックス用プライマーインデックス 24 SI for ChIPmentationを用いることによって複数のサンプルを同時にシーケンスすることも可能です。
さらに、マルチプレックス化におけるインデックスホッピングが原因の他サンプル配列混入を排除することが可能なユニークデュアルインデックス、24 UDI for Tagmented librariesを用いることにより、より正確なマルチプレックスシーケンスが実現可能です。
多様な目的にご使用いただけます
Tagmentaseは酵素内にアダプターが予めロードされていないものをunloadedとして提供しています。それによって、目的に応じてご自分で導入配列をロードさせたトランスポソームを構築し、作用させることが可能です。
Tagmentaseにお手持ちのオリゴヌクレオチドをロードするプロトコールは下でご覧いただけます（グローバルサイトにリンクします）。
Protocol: Transposome assembly for Diagenode Tagmentase
Illuminaシーケンサー互換のシーケンスアダプターがロードされたタグメンテーションキットをご希望の方はTAG kit for ChIPmentationをご利用ください。
ご使用の実験条件に柔軟に対応できます
お手元の実験条件に応じて最適なTagmentaseの濃度を調整・希釈するためのDiagenode Tagmentase Dilution Bufferを別売でご用意しております。
Tagmentation酵素選択ガイド
DiagenodeのTagmentase酵素・CUT&Tag酵素をどのように選択していただけるかを下表に示しました。それぞれの製品の詳細については、下にリンクを記しますのでグローバルサイトの各製品ページにてご確認ください。
| Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded (C01070012) | Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded (C01070010) | pA-Tn5 Transposase – loaded (C01070001) | pA-Tn5 Transposase – unloaded (C01070002) |
|
|---|---|---|---|---|
| ターゲットDNA断片化・配列挿入 | 高いTn5活性 | 高いTn5活性 | 高いTn5活性 | 高いTn5活性 |
| 導入DNA | Illumina互換シーケンスアダプター | なし・任意のアダプターを導入可能 | Illumina互換シーケンスアダプター | なし・任意のアダプターを導入可能 |
| テザリング（CUT&Tag用） | なし | なし | protein AとTn5の融合タンパク質 | protein AとTn5の融合タンパク質 |
| ChIPmentation （Illuminaシーケンサー） | ◎ | 〇 | ||
| タグメンテーション （Illuminaシーケンサー） | ◎ | 〇 | ||
| ChIPmentation （その他NGS・任意配列） | ◎ | |||
| タグメンテーション （その他NGS・任意配列） | ◎ | |||
| ATAC-seq（Illuminaシーケンサー） | ◎ | 〇 | ||
| ATAC-seq（その他NGS・任意配列） | ◎ | |||
| CUT & Tag（Illuminaシーケンサー） | ◎ | 〇 | ||
| CUT & Tag（その他NGS・任意配列） | ◎ | |||
| 備考 | Tagmentation buffer、シーケンシングインデックスは別にご用意ください。 | 動作には導入配列をご自分でロードしていただく必要があります。 Tagmentation buffer、シーケンシングインデックスは別にご用意ください。 | Tagmentation buffer、シーケンシングインデックスは別にご用意ください。 | 動作には導入配列をご自分でロードしていただく必要があります。 Tagmentation buffer、シーケンシングインデックスは別にご用意ください。 |
| ◎：最適 〇：適 | ||||
酵素
Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded (C01070010-10)
Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded (C01070012-10)
pA-Tn5 Transposase – loaded (C01070001)
pA-Tn5 Transposase – unloaded (C01070002)
反応バッファー
Tagmentation Buffer (2x) (C01019043)
インデックスプライマー
24 UDI for tagmented libraries (C01011034)
キット（Tagmentase – loaded同梱）
TAG kit for ChIPmentation (C01011030)
タグメンテーションには高いDNA断片化・タグ導入効率を持つDiagenodeのTagmentaseを是非ご利用ください。
Tagmentase (Tn5 transposase)
Diagenodeの高効率Tn5トランスポゼースであるTagmentaseはChIP-seqをはじめとした、次世代シーケンスライブラリーの調製が必要なすべての分野において力を発揮します。