Diagenodeは、RNA-seqによるトランスクリプトーム解析やmRNA発現解析を提供するRNA-seq受託解析サービスを提供しています。独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得、解析を加えた後結果をお手元にお届けします。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。
４つのオプションを提供します
ハイスループット3’mRNA-seq
mRNAの3’側を含むライブラリーを作成してシーケンスすることにより、多サンプル由来mRNAの発現量計数に特化した手法です。解読塩基数を大幅に節約し、コストを低減することが可能です。発現プロファイリング解析・発現変動解析にご利用いただけます。
mRNA-seq
polyA選択されたRNAを含むライブラリーを調製してシーケンスする手法で、新しい転写産物や選択的スプライスサイト、遺伝子融合など3’mRNA-seqでは検出できないイベントを検出できます。幅広いインプット量に対応します。
total RNA-seq
Small ncRNAとmiRNA解析
Small noncoding RNAとmiRNAを含むライブラリーを作成してシーケンスします。独自プラットフォームであるD-Plexテクノロジーを用い、スモールncRNAの発現解析が可能です。転写後発現調節の研究にご利用いただけます。
lncRNAを含む全トランスクリプトーム解析
コーディング・ノンコーディングRNAを含むライブラリーを作成してシーケンスします。オプションでrRNAの除去を行います。lncRNAの解析を通じて遺伝子構造・転写後発現調節・クロマチンリモデリングなど幅広い研究にご利用いただけます。
FAQ
本受託解析サービスの受託条件は以下の通りです。
ハイスループット3’mRNA-seq
- １プロジェクトには最小96サンプルが含まれている必要があります。
- 20 ng/μL以上の濃度の単離total RNA溶液10 μL以上をお送りください。
- total RNAの輸送容器は96-well plates (low bind, RNase free, Eppendorf, 0030129504)をご使用ください。
- 発現変動解析を行うRNAサンプルについては、比較対象となるサンプルが上限96サンプルとなる一つのライブラリー中で解析可能となるよう調整していただきます。サンプル数が多く、1つのライブラリーに入らない場合は適宜複数のライブラリーに分割いたします。
mRNA-seq
- １プロジェクトには最小24サンプルが含まれている必要があります。24サンプル単位でご注文ください。
- 10 ng以上のtotal RNAをお送りください。
total RNA-seq
- １プロジェクトには最小24サンプルが含まれている必要があります。24サンプル単位でご注文ください。
- 5 ng(ヒト、マウス、ラット由来)、100 ng(植物由来)以上のtotal RNAをお送りください。
- miRNA, small RNAの解析の際は10 ng以上のtotal RNAをお送りください。
Illuminaプラットフォームを用いて、1サンプル当たり以下のリード数が得られます。
- ハイスループット3’mRNA-seq: 4M raw read
- mRNA-seq: 25-30M raw read
- total RNA-seq: 50M raw read
サービス価格
| サービス | 受領サンプル | １サンプルあたり価格 | オプション解析（バイオインフォマティクス） |
|---|---|---|---|
| ハイスループット3'ｍRNA-seq | total RNA | ￥29,000/sample （サンプルQCなし） ￥36,000/sample （サンプルQCあり） | Differencial expression analysis Gene ontology terms analysis Pathway analysis |
| mRNA-seq | total RNA | ￥67,000/sample （サンプルQCあり） | Differential expression analysis Gene ontology terms analysis Pathway analysis Alternative splicing analysis Novel transcript identification |
| RNA-seq (total RNA-seq) | total RNA | ￥95,000/sample （サンプルQCあり） | Differential expression analysis Gene ontology terms analysis Pathway analysis Alternative splicing analysis Novel transcript identification |
サービスの流れ
DiagenodeのRNA-seq受託解析サービスでは、お客様が抽出したtotal RNAサンプルをお預かりし、Diagenodeの専門チームによる処理および解析を行って結果をお知らせします。
以下にサービスの流れを簡単にご説明いたします。
1. お問い合わせ・お見積り
お見積りをご希望の方は、下のリンク「サンプル情報フォーム」をクリックして、お客様のサンプルについての情報をご入力ください。
送付いただきました情報を基にお見積を作成し、弊社営業担当者より折り返しお見積と解析結果見本をお送りいたします。
正式なお見積は弊社営業担当者、またはご利用の代理店を通してお手元にお届けいたします。
お見積りとともに「Biosafety form」をお送りいたします。サンプル調製・送付ガイドラインでサンプルの受託条件をご確認いただき、サンプルの情報をご記入の上、ご注文前にご返送いただきますようお願いいたします（輸出可否の確認をさせていただきます）。
海外のラボで分析を行います関係上、輸出規制に該当する品目を含むサンプルについてはご相談させていただく場合がございます。
必要に応じて、秘密保持契約・業務委託契約を締結することも可能です。
サンプル調製・送付ガイドライン及びBiosafety formは下のリンクからダウンロードしていただくことも可能です。
mRNA-seq/ total RNA-seq
②サンプル調製ガイドライン
③サンプル送付ガイドライン
④Biosafety form
サービスの詳細や、その他のお問い合わせについて（資料請求、秘密保持契約の締結など）は、下リンクよりDiagenode SAグローバルサイト上の「お見積りボタン」をクリックしてお問い合わせください。
2. 注文書送付
受託解析をご依頼される際は注文書を弊社に直接、あるいは代理店を通してお送りいただきます。
注文を弊社で受領した段階で次の書類をお送りいたしますので、必要な情報をご記入の上、ご返送ください。
・サンプルIDシート
返送いただきましたら弊社で確認の上、分析するサンプルを送付していただくスケジュールを調整・ご連絡させていただきます。
3. サンプル送付
サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従ってゲノムDNAサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。
弊社で確認後、Diagenode SAにサンプルを送らせていただきます。
4. 解析作業
Diagenode SAで実施する作業は以下の通りです。
・サンプルの品質管理（オプション）
RINとRNA濃度の決定を行います。サンプルに不備があった場合はこの段階で追加のサンプル提供についてご相談させていただきます。
・polyA RNA精製とrRNA除去
・ストランド化・マルチプレックスライブラリーの調製
・ライブラリーの品質管理
・Illuminaプラットフォーム上での次世代シーケンシング
・バイオインフォマティクスに基づく解析（オプション）
5. 納品物送付
オプションで追加される解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。
詳しくはグローバルサイトをご覧いただくか、下のお問い合わせボタンをクリックしてお問い合わせフォームにご入力ください。弊社営業員が折り返しご連絡申し上げます。
エピジェネティクス受託解析サービス
DiagenodeではRNA-seqの他にも多くのエピジェネティクス関連受託サービスを承っております。下のページにてご紹介しておりますので、ご希望の解析に応じてご検討ください。
