WGBS受託解析サービス

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Diagenodeは、全ゲノム上のDNAメチル化部位の状態を一塩基単位の解像度で網羅的に解析する手法であるWGBS受託解析サービスを提供しています。

WGBS(Whole Genome Bisulfite Sequencing) 法は、バイサルファイト処理を行った全ゲノムDNAを次世代シーケンスで塩基配列を解読し、レファレンス配列と比較することによって全ゲノム上のメチル化部位を網羅的に把握することが可能です。

独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得、解析を加えた後結果をお手元にお届けします。

メチル化情報をクロマチン状態の情報と併せて評価することが可能なChIP-Bis-Sequencingなどの手法についても、弊社のワークフローでライブラリー調製が可能であることが確認されています。

お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。

全ゲノム上のメチル化部位を1塩基の分解能で網羅的に解析します

ライブラリー調製

お送りいただいたゲノムDNAサンプルはPicoruptorテクノロジーを用いて断片化します。品質管理を行い、次世代シーケンス用ライブラリーを調製します。

バイサルファイト処理

ライブラリーのバイサルファイト処理を行った後、増幅・クリーンアップ・品質管理を行います。

次世代シーケンシング

Illuminaプラットフォーム上でのシーケンシングを行います。シーケンス深度や解析のカスタマイズ・幅広い解析オプションもご利用いただけます。

バイオインフォマティクス解析

多彩な解析オプションを取り揃えています。

  • 基本解析

    データ統計・リードクリーニング・アラインメント・メチレーションコール・アノテーション

  • 高次解析(追加オプション解析)

    示差解析・可変メチル化シトシン/領域のアノテーション・主成分分析・GO解析・パスウェイ解析

  • 解析のカスタマイズ

    上記にない解析法をご希望の場合は弊社営業担当者にご相談ください。

サービスの流れ

DiagenodeのWGBS受託解析サービスでは、お客様のゲノムDNAサンプルをお預かりし、Diagenodeの専門チームによる処理および解析を行って結果をお知らせします。

以下にサービスの流れを簡単にご説明いたします。

1. お問い合わせ・お見積り

お見積りをご希望の方は、下のリンク「サンプル情報フォーム」をクリックして、お客様のサンプルについての情報をご入力ください。

送付いただきました情報を基にお見積を作成し、弊社営業担当者より折り返しお見積と解析結果見本をお送りいたします。

正式なお見積は弊社営業担当者、またはご利用の代理店を通してお手元にお届けいたします。

お見積りとともに「Biosafety form」をお送りいたしますので、サンプル調製・送付ガイドラインでサンプルの受託条件をご確認の上、サンプルの詳細情報をご記入いただけますようお願いいたします(輸出可否の確認をさせていただきます)。

海外のラボで分析を行います関係上、輸出規制に該当する品目を含むサンプルについてはご相談させていただく場合がございます。

必要に応じて、秘密保持契約・業務委託契約を締結することも可能です。

サンプル調製・送付ガイドライン及びBiosafety formは下のリンクからダウンロードしていただくことが可能です。

①サンプル調製・送付ガイドライン
②Biosafety form

サービスの詳細や、その他のお問い合わせについて(資料請求、秘密保持契約の締結など)は、下リンクよりDiagenode SAグローバルサイト上の「お見積りボタン」をクリックしてお問い合わせください。

WGBS受託サービス(グローバルサイト)

2. 注文書送付

受託解析をご依頼される際は注文書を弊社に直接、あるいは代理店を通してお送りいただきます

注文を弊社で受領した段階で次の書類をお送りいたしますので、必要な情報をご記入の上、ご返送ください

・サンプルIDシート

返送いただきましたら弊社で確認の上、分析するサンプルを送付していただくスケジュールを調整・ご連絡させていただきます。

3. サンプル送付

サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従って分析するサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。

弊社で確認後、Diagenode SAにサンプルを送らせていただきます。

4. 解析作業

Diagenode SAで実施する作業は以下の通りです。

・ゲノムDNAの品質管理

・ライブラリー調製

・免疫沈降操作

ライブラリーの品質管理

・次世代シーケンシング
・バイオインフォマティクスに基づく解析
品質管理・レファレンスゲノムへのアラインメント・メチル化コーリングがサービスに含まれます。

5. 納品物送付

オプションで追加される解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。

詳しくはグローバルサイトをご覧いただくか、下のお問い合わせボタンをクリックしてお問い合わせフォームにご入力ください。弊社営業員が折り返しご連絡申し上げます。

エピジェネティクス受託解析サービス

DiagenodeではChIP-seqの他にも多くのエピジェネティクス関連受託サービスを承っております。下のページにてご紹介しておりますので、ご希望の解析に応じてご検討ください。

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