RNA-seq受託解析サービス

本受託解析サービスでの必要RNA量は以下の通りです。

• Total RNA-seq: 最少5 ng以上のTotal RNA（植物由来の場合は100ng）をお送りください。
• mRNA-seq: 最少10 ng以上のTotal RNA（植物由来の場合は100ng）をお送りください。

結果を最大化するため、RNA調製とサンプル送付に関するガイドライン (別紙「サンプル調製・送付ガイドライン」)を厳守してください。

オーダーは最低9サンプルより承っており、正確な実験結果を得るため、反復実験の数をご依頼になるサンプルの数に含めてください。1試験条件あたり最小3回以上の反復実験を実施することを推奨しております。

本受託解析サービスでは以下の生物種について解析いたします。

miRNA、sncRNA、mRNA：真核生物

lncRNA (Total RNA-seq)：ヒト・マウス・ラットのみ

ご希望の方はRNA抽出をご依頼の旨、お問い合わせ時にお申し出ください。

サンプルの種類を明確にお知らせください。受入を実施するサンプルの種類は凍結細胞ペレット・凍結組織・精製total RNA・FFPEです。

FFPEはlncRNA (total RNA)でのみ受け付けます（mRNA-seqを実施することはできません）。

分析したい分子種に応じたシーケンシングができるのはもちろんですが、基本的なmRNAの発現解析、深度を上げた少量転写産物の解析、新規RNA分子種の発見など目的を絞ってご依頼ください。

本受託解析ではスタンダード解析とアドバンスト解析2種のバイオインフォマティクス解析をご利用いただけます。

スタンダード解析

・リファレンス配列へのアラインメントと発現量算出

アドバンスト解析

スタンダード解析に加えて

・発現量比較解析
・Unsupervised analysis (クラスタリング・主成分解析)
・Gene Ontology （GO解析）and/or Pathway Enrichment Analysis of differential expressed genes
・機械学習（大きなデータセット・データ統合に最適）

をご選択いただけます。

その他、特殊な解析をご希望のお客様には、弊社バイオインフォマティクスチームがカスタムで解析パイプラインを追加いたします。

マルチオミクスのプロジェクトで、複数の実験結果を統合したい（例えばWGBSとRNA-seqのデータを統合したい場合など）ケースも対応可能ですので、ご相談ください。

料金は

スタンダード解析は1注文あたり1セットアップ費　＋サンプル当たりの解析費
アドバンスト解析の場合は1注文あたり1セットアップ費　＋1群間比較あたりの解析費

となっております。

弊社で推奨している各解析の推奨取得リード数は以下の通りです。
・miRNA、sncRNAの解析：10-20M reads
・mRNAの解析：25-30M reads
・lncRNAの解析：45-50M reads