エピジェネティクス ニュースレターVol.1


ダイアジェノード日本支社を開設


ニュース:

Diagenodeは、エピジェネティクス研究に携わる日本の研究者の皆様のニーズに応えるため、2017年7月に日本支社を設立しました。 日本支社を開設することで、今まで以上に迅速なカスタマーサポートの提供や、新製品に関する最新情報をいち早くお知らせすることが可能になりました。また、商品を弊社から直接ご購入頂けるオプションをご用意することで、世界中のエピジェネティクス研究で使用されている 弊社製品を、より低価格でご提供する事ができます。

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今後の学会出展予定

  • 12th Asia Epigenomics Meeting
  • 日時:平成29年9月12日~13日
  • 場所:グランドホテルニュー王子 北海道
  • 第76回日本癌学会学術総会
  • 日時:平成29年9月28日~30日
  • 場所:パシフィコ横浜

エピジェネティクスとは?

クロマチン

クロマチンは、DNA、ヒストンおよび非ヒストンタンパク質から成ります。 クロマチンを形成するために、DNAはヒストンと呼ばれる核タンパク質の周りにしっかりと巻き付きます。 一般的に、より高度に濃縮されたクロマチンには、転写因子および他のDNA結合タンパク質がDNAにアクセスすることができず、遺伝子発現に影響を及ぼします。 したがって、ヒストンおよび転写因子の役割を理解することは、遺伝子発現の調節を理解する上で非常に重要です。

クロマチン免疫沈降(ChIP)と呼ばれる技術は、タンパク質-DNA相互作用を研究するための有用なツールです。 ChIPを用いることで、特定のタンパク質が転写因子の標的配列に結合するか否かを判定することが可能になります。また、正常状態と疾患状態とを比較するために、2つの異なる試料中の特定のプロモーターに作用するヒストンメチル化のレベルを調べることができます。 ChIP実験では、クロマチンを抽出して断片化し、続いて抗体によりタンパク質-DNA複合体を捕捉し回収します。 次いで、濃縮されたDNAをChIP-qPCRまたはChIP-seqによって分析します。

DNAメチル化

DNAメチル化は、主にGC含量の高いCpGアイランドと呼ばれる領域におけるシトシン塩基上の5 ‘位で起こります。 このシトシン修飾は、遺伝子のサイレンシングおよびセントロメアの安定性に関与します。CpG領域の頻繁に変異が入ると、 5-メチルシトシンは、しばしばin vivoで脱アミノ化されます。このようなエピジェネティックの変化は、癌、自己免疫疾患、および様々な発達障害などつながる永続的な遺伝子変異を引き起こす可能性があります。

DNAメチル化パターンおよび修飾は、目的の解析レベルに応じて様々な方法を用いて研究することが可能です。一塩基の解像度で解析するために、バイサルファイト変換後にシークエンスする方法が良く行われます。非メチル化シトシンが化学的にウラシルに変換されている間、メチル化シトシンはこの変換から保護されています。また、100-500bpの解析レベルを得るために、メチル化DNAは、断片化ゲノムDNA中のメチル化CpG領域に結合する特異的抗体(MeDIP法)またはタンパク質(MethylCap法)を用いて濃縮されます。 濃縮されたDNAは、次世代シークエンスまたはqPCRによって解析されます。

エピジェネティックな変化は自然にまたは環境の影響受けて起こり得ます。 いくつかの変化は、遺伝子発現の変化をもたらすことで、発達障害や疾患を引き起こす可能性があります。 エピジェネティックなメカニズムやプロセスを理解することは、癌、炎症性疾患や自己免疫疾患のための新しい治療法を見つける上で非常に重要です。


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