【FAQ】分解したDNAでMeDIPを行える?
MagMeDIPアッセイで使用するDNAの品質は重要です。したがって、培養細胞からタンパクなど夾雑成分の少ないDNAを抽出していただき、その際ゲノムDNAの抽出および精製には、Diagenode XL GenDNA Extraction Module (このパッケージに含まれています) のご使用をお勧めしています。(血液または組織サンプルからのDNAの抽出には、他の特定のキットが必要な場合があります。)
gDNA分離用のXL GenDNA Extraction Moduleは、100万から 150万の培養細胞から約60 μgのDNAバッチの調製に十分な量の試薬を提供します。
実験前に品質評価を実行しておくことにより、機能を有するDNAテンプレートが十分な多様性を備えていることを担保する、有益なサンプルを取得できます。
このような品質評価により、エンドポイントの結果がテンプレート配列上の非代表的セットに左右されず、サンプルの配列多様性全体を再現性良く反映する可能性が高くなります。