ChIP実験の成功のカギは、目的の生物学的シナリオの状態を反映する断片化クロマチンの調製にあります。 高品質のクロマチンサンプルは、クロマチン断片サイズの分布が適正で、またChIP …
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ChIP-Seqはクロマチン免疫沈降(ChIP)と次世代シーケンスを組み合わせたもので、転写因子などのゲノム全体におけるDNA結合部位を同定する優れた方法です。ここではChIP-seqに関する技術的な情報を含む記事を示します。
Chapter 8. クロマチン断片化条件を選びましょう
クロマチン断片化には超音波処理装置の条件設定が大事ですが、超音波処理条件は多くのパラメータに左右され、希望の鎖長の断片を得ることは困難です。以下にクロマチン断片化条件の決定のポイン …
Chapter 9. 次世代シーケンシングとバイオインフォマティクス
次世代シーケンシング(Next Generation Sequencing, NGS)は、ランダムに切断された数千万―数億のDNA断片の塩基配列を同時並行的に決定する実験手法です。 …
Chapter 10. ChIP実験マニュアル・ガイド
ChIPは原理は単純ですが、それぞれのプロセスにおいてパラメーターの多い複雑な実験系です。 Diagenode社ではChIP実験試薬および超音波処理装置メーカーとしてこれまでにノウ …
Chapter 11. ChIPを用いた転写因子の解析
転写因子(てんしゃいんし)はDNAに特異的に結合するタンパク質の一群です。細胞内で遺伝子が生涯を通じて適切な時に正しい量で正しい細胞において確実に発現されるように、転写を制御してオ …
Chapter 12. 少量細胞からChIP-seq解析を行う方法
次世代シーケンシング技術(NGS)が普及しより利用しやすくなるにつれて、ヒストンマークまたは転写因子の結合部位の同定や、タンパク質-DNA相互作用のゲノムワイドマッピングには、クロ …
Chapter 13. CUT&Tag法によるクロマチン構造解析
CUT & Tag法とは CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)とは、タンパク質とゲノムの相互作用を研究するため …
クロマチン免疫沈降|エピジェネティクス研究で使用される実験手法
エピジェネティクス研究は、異なる転写パターン、遺伝子発現およびサイレンシングを引き起こすDNA上のメチル修飾や、 クロマチン の変化を対象としています。 クロマチンはDNAおよびヒ …