特定の細胞で既知のターゲット配列が存在しない場合、ChIPが成功したかどうかを判定する方法はありますか？

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提案できる方法としては、目的のタンパク質のゲノム上の結合部位を推定し、その配列を基にqPCRのプライマー配列を推定し、スクリーニングすることです。

この方法がうまくいかなかったとしても、シーケンシングによってChIPの確認を行うことは可能です。

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