アガロースゲル上で大量のクロマチンが移動すると、実際のDNA断片化を反映しない画質の低下が生じる可能性があるため、ゲルに過負荷をかけないようにします。
切断されたクロマチンからの最適なDNA量は、1レーンあたり約300ngとしてください。100ngから500ngまで希釈系列を作成して最適な濃度を検討することも可能です。
正確な断片化評価のためには、1.2～1.8%アガロースゲル上で剪断されたクロマチンを泳動してください。
また、アガロースゲルで可視化できる最少の剪断クロマチン量は60,000細胞相当に相当します。
