Diagenodeはエピジェネティクス用試薬サプライヤーとして、クロマチン免疫沈降実験に必要な機器・試薬を網羅的に取り揃えております。 クロマチン免疫沈降実験の手順ごとに、最適なDiagenode製品・カタログ番号および製品リンクを以下に示しました。それぞれのステップをクリックしてリンクを表示してください。
クロマチン免疫沈降
Step 1 架橋化
DNAとタンパクのクロスリンク
DNAとタンパク質、タンパク質とタンパク質をクロスリンクするステップです。
転写因子の相互作用に着目してChIPの実験を行う場合はChIP Cross-link Goldなども含めたクロスリンク条件の検討が推奨されます。
Diagenode製品
Step 2 クロマチン断片化
超音波処理によるクロマチン断片化
クロスリンクしたDNA-タンパク質複合体を細胞外に放出するため、細胞を可溶化剤で可溶化し、超音波破砕装置を用いてDNAを断片化します。
可溶化剤の濃度や超音波破砕装置の設定を検討するキットを用いて条件検討を行います。
Diagenode製品
超音波破砕装置
Picoruptor 2（Diagenode B01080010）
破砕条件検討用試薬キット
Chromatin EasyShear Kit Low SDS（Diagenode C01020013 ）
Chromatin EasyShear Kit Ultra Low SDS（Diagenode C01020013 ）
Step 3 免疫沈降
免疫沈降による目的クロマチンの濃縮
ChIP grade抗体を加え、タンパク質と結合させて、免疫沈降によってクロマチンを沈殿させます。
様々なサンプルや実験内容に応じたChIP実験キットを用いて行うことができます。
ChIPキットは断片化・免疫沈降・DNA精製用試薬と必要なコントロールが全て含まれています（目的サンプルに対するChIP-grade抗体は別にお買い求めください）。
Diagenode製品
ChIP-seqキット・ヒストン、転写因子用
iDeal ChIP-seq kit for Histones C01010051
iDeal ChIP-seq Kit for Transcription Factors C01010055
少量細胞用ChIPキット
True MicroChIP kit C01010130
ChIP-qPCR用キット
iDeal ChIP-qPCR C01010180
植物細胞用キット
Universal Plant ChIP-seq C01010152
ChIP, ChIP-seqグレード抗体
ChIP・ChIP-seqグレード抗体
Step 4 脱架橋化
DNAの脱クロスリンクと精製
タンパク質とDNAを脱クロスリンクによって分離し、DNA部分を精製します。
Diagenode製品
免疫沈降DNA精製キット
IPure kit v2 （Diagenode C03010014 ）
(ChIP kitにはIPure kitが含まれます)
Step 5 DNAの解析
精製DNAの解析
精製したDNAから次世代シーケンサー用のライブラリーを構築します。
構築したライブラリーをシーケンスして配列を決定し、解析を行ったり、精製したDNAから直接qPCRによって目的配列を含むDNAの定量を行います。
Diagenode製品
NGSライブラリ調製キット
MicroPlex Library Preparation Kit v2（Diagenode C05010012）
ChIP-qPCR用マスターミックス
Universal Mastermix 7.5ml（Diagenode DMMLD2D600）
次世代シーケンス用インデックス
24 SI for ChIPmentation（Diagenode C01011031）
ChIPmentation・CUT&Tag・ATAC-seq
ChIP-seqキット・ヒストン用
ChIP用試薬とタグメンテーションによるライブラリー調製キットが含まれるオールインワンのキットです。
タグメンテーション用キット
ご使用のChIPの系で得られたクロマチンDNAを用いて、タグメンテーションでシーケンスライブラリーを調整できます。
高効率Tn5 transposase酵素
アダプターが導入されていない高効率のTn5 transposaseです。オリゴヌクレオチドを導入して独自のトランスポソームを構築することが可能です。
CUT&Tag用融合タンパク質
抗体にテザリングするためのProtein AとTn5トランスポゼースからなる融合タンパク質です。効率よくDNAを断片化し、アダプタータグを導入します。
pA-Tn5 Transposase – loaded（Diagenode C01070001）
pA-Tn5 Transposase – unloaded（Diagenode C01070002）
次世代シーケンス用インデックス
最大24個のサンプルをマルチプレックスできる、Illuminaプラットフォーム用のシーケンスインデックスです。
24 SI for ChIPmentation（Diagenode C01011031）
24 UDI for Tagmented libraries set I（Diagenode C01011034）
ATAC-seq kit
最小50000個の細胞からATAC-seqを実施していただけるキットです。
ATAC-seq kit（Diagenode C01080002）
ATAC-seq package for tissue
組織サンプルからの核抽出試薬とDNA精製試薬やUDIを含むATAC-seqキットを同梱したパッケージをご用意いたしました。