1つのChIP-seqライブラリーに対し、実際にどのくらいのリード数を費やす必要がありますか?




【FAQ】ChIP-seqに必要なリード数について



これは、目的のタンパク質によって異なります。鋭いピークを持つヒストン修飾の場合は3,000万リード(H3K4m3)、ピーク幅が広く量が多いもの(H3K27m3など)の場合、約5,000万リードが推奨されます。



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