MeDIPやhMeDIPの反応ではなぜMsp1消化よりも超音波処理をした方がいいのですか？RRBSのようにMsp1処理によりCpGに富んだ配列を得ることができるのではないでしょうか。

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MeDIPの場合、その後の免疫沈降に適した範囲の断片を得るために、超音波処理を行う必要があります。

酵素分解では、免疫沈降に適した鎖長範囲の断片が得られないので、その後のサイズセレクションが必要です。また、MeDIPでは、5mCを全て免疫沈降する特異性の高い抗体を使用するため、CpGが豊富な領域は必要ありません。

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