RNA-seq、ATAC-seqとChIP-seqのデータを統合するにはどのようにすればよいですか?




【FAQ】NGSデータ解析結果の統合について



ChIP-seqおよびRNA-seqデータは、2つのアッセイにおけるランク付け遺伝子及びランク外遺伝子リストの重なりを決定することにより、離散化された方法で統合できます。

近年のアプローチでは、複数の転写因子およびヒストンマークからのChIP-seqデータを、発現量のデータおよびATAC-seqなどのアクセシビリティデータと組み合わせています。

これらのメソッドを統合するために利用できるツールとパイプラインがいくつか存在しています。



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