Lysis Buffer（可溶化バッファー）に1% SDSが入っているのですが、多すぎませんか？サンプルの変性が気になります。

SDSは1%までの濃度で添加することによってソニケーション効率を向上させることができます。しかしながら、添加することによりターゲットタンパク質が変性したり、高次構造を解離させるリスクも増大します。

従って、実験条件やターゲットの種類に合わせたSDSの最小濃度を決めて実験することが大事です。

他の界面活性剤はSDSのソニケーション効率向上の効果を打ち消す場合があるため、可溶化バッファーやソニケーションバッファーの組成にはバランスを考慮する必要があります。

ダイアジェノードのEasyShear kitやChIP kitでは、ChIPのターゲットに応じて、SDS量を最適化したバッファーを使用していただけます。

• – <0.1% SDS：ヒストンのChIP用
• – 0.2% SDS：転写因子のChIP用
• – <0.5% SDS：植物のChIP用
• – 1% SDS：低インプットのChIP用 (ワンステップ可溶化、収率極大化)

また、SDSの濃度を変えた場合の検証済みの断片化プロトコールについてもご用意しています。詳しくは下のURLをご覧ください。

https://www.diagenode.com/jp/categories/chromatin-shearing（グローバルサイトにリンクします）