超音波処理の代わりに酵素的処理による断片化は使用できますか？酵素的断片化によって NGS 分析にバイアスが生じるのでしょうか。

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酵素による断片化は、配列に基づくバイアスが生じるリスクが常にあり、またまれにワークフローによるバイアス、酵素の制限部位へのアクセシビリティによるバイアスなどが生じます。

さらに、最適な酵素消化効率のための条件を得ることが難しいため、実験間の再現性が低くなります。したがって、超音波処理による断片化を強くお勧めします。

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