シーケンシング用にプールする必要があるインプットの種類と数をどのように決めればよいですか?




【FAQ】ChIP-seqで測定するインプットサンプルについて



ChIP-seqとChIP-qPCRでのゴールドスタンダードは、サンプルごとに1つのインプットを測定することです。同じサンプル中の複数のChIPターゲットについては、同じインプットで参照できます。

場合によっては、シーケンスのコストを削減するために、複数のインプットをプールすることが合理的です。

これは、サンプルがどの程度類似しているかによって異なり、例えば培養細胞の場合、細胞の生物学的グループごとに1 つのインプットが一般的に使用されます。



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