ライゲーションによるライブラリー調製に比べてタグメンテーションでは切断部位にバイアスがかかるのではと思うのですが。




【FAQ】CUT&Tagで配列バイアスはかかる?



CUT&Tagライブラリー作製では、目的の標的に対する一次抗体の結合部位に連関する配列がターゲットで、Tn5による断片化部位の配列は比較的重要ではないため、バイアスは無視できます。

ChIPと比較して、ヒストンマーク特異的な結合の検出感度が高くなるので、ChIPよりも少ない細胞を使って実験することができます。



おすすめ