【FAQ】ChIP-seqで測定するインプットサンプルについて
ChIP-seqとChIP-qPCRでのゴールドスタンダードは、サンプルごとに1つのインプットを測定することです。同じサンプル中の複数のChIPターゲットについては、同じインプットで参照できます。
場合によっては、シーケンスのコストを削減するために、複数のインプットをプールすることが合理的です。
これは、サンプルがどの程度類似しているかによって異なり、例えば培養細胞の場合、細胞の生物学的グループごとに1 つのインプットが一般的に使用されます。