ヒトサンプルで正しいシーケンス深度を得るために、Illumina HiSeq 2000/2500プラットフォームではレーンあたり6サンプル、またはHiSeq 3000/4000ではレーンあたり8サンプルをシーケンスすることをお勧めします。
他の種については、ゲノムサイズとゲノム上の読み取りのマッピング効率に基づいて、何重のマルチプレックスを実施するか推定する必要があります。
Diagenode は最大 48 個のバーコードを提供するため、非常に小さなゲノムを持つ種に取り組む場合であれば最大 48 個のサンプルをまとめてプールできます。
また、ヒトサンプルの場合は、48個のサンプルをプールして複数のフローセルに分配して分析することで対応します。
