【FAQ】ChIPにスパイクインコントロールは必要？
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インプットはプールできますか？可能な場合、インプットは何サンプルまでプールできますか／プールする必要がありますか？
【FAQ】MeDIP-seqで使用するインプットサンプルについて
DNAメチル化解析手法のうち、すでに標的遺伝子を特定している場合はどの手法が最も適しているのでしょうか？DiagenodeでRRBSを行ったところ、処理後に大量のデータが送られてきて、目的のプロモーターの修飾度を調べるのは容易ではありませんでした。どうすれば目的のプロモーターのメチル化レベルを見ることができるのでしょうか？一般的な差分メチル化解析、遺伝子オントロジー、パスウェイ解析しか知らないのですが、プロモーターを特定する必要があります。
【FAQ】RRBSで得られたデータの解析手法について
ヘテロクロマチンのヒストンマークはChIPしにくいようです。これらのマークのChIP効率を上げるためにはどのステップを最適化すればよいでしょうか？
【FAQ】ヘテロクロマチンのヒストンマークのChIPについて
カバレッジを下げるために サンプル量を25 ng以下にして分析することは可能ですか？
【FAQ】RRBSのサンプル量をどこまで減らせますか？
超音波処理の代わりに酵素的処理による断片化は使用できますか？酵素的断片化によって NGS 分析にバイアスが生じるのでしょうか。
【FAQ】ゲノムDNAの断片化方法について
シーケンシング用にプールする必要があるインプットの種類と数をどのように決めればよいですか？
【FAQ】ChIP-seqで測定するインプットサンプルについて
抗体とビーズ間の非特異的結合を減らすための BSA の添加について、どのくらいの量を使用することが推奨されますか？
【FAQ】免疫沈降ミックスへのBSAの添加量
購入したソニケーターが正しく機能しているかどうかについて試験する方法はありますか？
【FAQ】ソニケーターのせん断効率チェックは可能？
断片化済みのフラグメント長をさらに短くするにはどうすれば良いですか？
【FAQ】断片化DNAをさらに短くする？