Diagenodeは、網羅的なヒトゲノム上メチル化DNAの手軽な解析方法としてInfinium Methylation EPIC Array受託解析サービス、およびヒドロキシメチル化の解析方法としてInfinium Hydroxymethylation oxEPIC Array受託解析サービスを提供しています。
また、マウスゲノム上メチル化DNAの解析に対応したInfinium Mouse Methylation Array受託解析サービスの提供も開始いたしました。一般的な実験用マウスのモデル系統に対応可能で、ヒドロキシメチル化の解析も提供しております。
独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元にお届けします。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。
サービス概要
| サービス内容 EPIC・oxEPIC array | ・バイサルファイト処理 ・アレイハイブリダイゼーションおよび分析 ・スタンダード解析 (アノテーションデータと生データを納品 ) ・一塩基分解能でヒトゲノム上の850,000以上のCpG部位をカバー ・CpG、非CpG、およびCHH部位の定量分析が可能 |
| サービス内容 Mouse Methylation array | ・バイサルファイト処理 ・アレイハイブリダイゼーションおよび分析 ・スタンダード解析 (アノテーションデータと生データを納品) ・一塩基分解能でマウスゲノム上の285,000以上のCpG部位をカバー |
| 必要サンプル数 | 8サンプルから受付*（8の倍数で承っております） |
| 必要サンプル数 Mouse methylation array | 12サンプルから受付*（12の倍数で承っております） |
| 必要サンプル数 oxEPIC array | 4サンプルから受付*（4の倍数で承っております） |
| 必要サンプル数 Mouse methylation oxEPIC array | 6サンプルから受付*（6の倍数で承っております） |
| 必要サンプル量(通常) | 最小：500 ng DNA (サンプル濃度・≥10 ng/ μL) |
| 必要サンプル量(FFPEから抽出*) | 最小：250 ng DNA (サンプル濃度・≥10 ng/ μL) |
| *FFPE由来サンプルからの抽出処理は別途料金が発生します。 | |
| EPIC array 価格（/1サンプル） | ￥45,000～￥69,000 |
| oxEPIC array 価格（/1サンプル） | ￥158,000～￥193,000 (QCなし) |
| Mouse Methylation array 価格（/1サンプル） | ￥49,000～￥66,000 |
| Mouse Methylation array oxEPIC 価格（/1サンプル） | ￥133,000～￥188,000 (QCなし) |
| **サービス完了期間：約８-10週間です。 | |
| アドバンスト解析*** (Infinium EPIC array/ oxEPIC array用) | ・Differential methylation analysis ・Gene ontology ・Pathway analysis |
| セットアップ費 | お見積 |
| 解析費／1サンプル | お見積 |
| ***Mouse Methylation Arrayのアドバンスト解析については弊社にお問い合わせください。 | |
Infinium Methylation Array受託解析サービスの流れ
DiagenodeのInfinium Methylation EPIC Array/ Infinium Mouse Methylation Array受託解析サービスでは、お客様が抽出したゲノムDNAサンプルをお預かりし、Diagenodeの専門チームによる処理および解析を行って結果をお知らせします。
以下にサービスの流れを簡単にご説明いたします。
1. お問い合わせ・お見積り
お見積りをご希望の方は、下のリンクをクリックして「お見積リクエストフォーム」よりお客様のサンプルについての情報をご入力ください。
送付いただきました情報を基にお見積を作成し、弊社営業担当者より折り返しお見積をお送りいたします。
お見積と共に、本サービスのサービスガイドライン及び解析結果の見本もお送りいたします。
サービスガイドラインは下のリンクからダウンロードしていただけます。
① Infinium Methylation EPIC array
② Infinium Mouse Methylation array
正式なお見積りは弊社営業担当者、またはご利用の代理店を通してお手元にお届けいたします。
お見積りとともに「Biosafety form」をお送りいたしますので、サンプル調製・送付ガイドラインでサンプルの受託条件をご確認の上、サンプルの詳細情報をご記入いただけますようお願いいたします（輸出可否の確認をさせていただきます）。
海外のラボで分析を行います関係上、輸出規制に該当する品目を含むサンプルについてはご相談させていただく場合がございます。
必要に応じて、秘密保持契約・業務委託契約を締結させていただくことも可能です。
サンプル調製・送付ガイドライン及びBiosafety formは下のリンクからダウンロードしていただくことが可能です。
①サンプル調製・送付ガイドライン
②Biosafety form
サービスの詳細や、その他のお問い合わせについて（資料請求、秘密保持契約の締結など）は、Diagenode SAグローバルサイト上の「お見積りボタン」をクリックしてお問い合わせください。
2. 注文書送付
受託解析をご依頼される際は注文書を弊社に直接、あるいは代理店を通してお送りいただきます。
注文を弊社で受領した段階で次の書類をお送りいたしますので、必要な情報をご記入の上、ご返送ください。
・サンプルIDシート
返送いただきましたら弊社で確認の上、分析するサンプルを送付していただくスケジュールを調整・ご連絡させていただきます。
3. サンプル送付
サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従ってゲノムDNAサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。
弊社で確認後、Diagenode SAにサンプルを送らせていただきます。
サンプル調製・送付ガイドラインの内容は下のリンクからダウンロードしていただくことが可能です。
4. 解析作業
Diagenode SAで実施する作業は以下の通りです。
・サンプルの品質管理
Qubit (Thermo Fisher)を用いて品質管理を行います。サンプルに不備があった場合はこの段階で追加のサンプル提供についてご相談させていただきます。
・バイサルファイト処理
・メチレーション特異的PCRを用いたバイサルファイト変換の確認
・全ゲノム増幅
・アレイハイブリダイゼーション
・一塩基伸長反応
・アレイスキャナーによる検出
・バイオインフォマティクスに基づく解析（一部オプション）
5. 納品物送付
解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。
詳しくはグローバルサイトをご覧いただくか、下のお問い合わせボタンをクリックしてお問い合わせフォームにご入力ください。弊社営業員が折り返しご連絡申し上げます。
エピジェネティクス受託解析サービス
DiagenodeではInfinium Methylation EPIC Arrayの他にも多くのエピジェネティクス関連受託サービスを承っております。下のページにてご紹介しておりますので、ご希望の解析に応じてご検討ください。
